为了实现虚拟仿真实验教学管理的规范化、制度化和标准化，学校制定了《实验中心管理条例》、《本科生实验教学管理规定》等一系列文件；中心结合自身情况，制定了一系列教学管理制度，并汇编成册，使各项工作做到有章可循，如《虚拟仿真实验教学中心岗位职责》、《虚拟仿真实验教学中心仪器设备管理办法》等。这些制度充分体现了规范化、制度化、标准化、人性化和以学生为本的思想。

①安全制度。中心一直把安全工作放在各项工作的首位，制定了《安全工作制度》、《教学实训安全制度》、《指导教师安全责任制度》、《实训室安全管理规定》、《安全防火制度等一系列安全制度》等规章制度，保障学生在中心学习过程中的安全。

②教学管理制度。中心结合学校教学管理各项规章制度，严格中心教学管理制度，保证中心的教学质量，制定了《教学管理条例》、《学生实训守则》、《学生实验守则》、《学生成绩考核标准》、《选修课管理制度》、《创新实验室开放管理规则》、《实验室开放管理办法》、《工作档案管理制度》等一系列规章守则。

③教师管理制度。中心为保证教师教学质量，制定了如《中国石油大学（华东）本科教学激励机制实施办法》、《师资培养办法》、《实训室实训教师守则》等系列教师管理及激励制度，对中心人员的岗位实行双向选择，集中统一管理；专职教师竞聘实验教学任务，实行流动式管理机制。每学期末结合教学和管理工作量要求，进行量化考核。

④设备管理制度。为强化实验实训仪器装备的管理，中心结合学校相关制度制定了详尽的设备管理规定，如《中国石油大学（华东）计算机软件购置管理暂行方法》、《实验室仪器设备管理制度》、《材料库管理制度》等，每台仪器设备均有专人管理，管理人员根据各设备的操作规程定期对实验设备进行维护，保障了仪器设备的正常使用。